Sim! Recentemente tive que fazer uma tarefa muito especifica e precisei trabalhar com os arquivos de mapeamento do EF, você provavelmente nunca precisará se preocupar com isso o Visual Studio cuida disso para você, mais se um dia precisar você vai se deparar com três arquivos com as seguintes extensões CSDL,SSDL e MSL.
O arquivo CSDL define o modelo conceitual o SSDL define o modelo físico e o arquivo MSL faz o mapeamento do modelo conceitual para o modelo físico, esses três arquivos são por padrão distribuídos como Embed, por isso geralmente eles nem são lembrado, mais basta uma olhada com mais calma na connectionString da aplicação para encontrar referências aos arquivos de mapeamento, se você precisar acessar esses arquivos você pode alterar a propriedade “Metadata Artifact Process” para “Copy to Output Directory”.
O arquivo EDMX utilizado em modo design no Visual Studio também é um arquivo XML com as três definições, mais as definições de designer.
Quem diz que o Entity Framework não tem arquivo XML esta falando bobagem, o correto seria dizer "Eu não preciso me preocupar com isso!".
Daniel Fonseca Castro